Транскриптомика одиночных клеток

Биологический факультет МГУ / Магистратура «Геномика и здоровье человека» / Осень 2025

Программа курса

Курс состоит из 8 занятий. Все материалы будут выкладываться на этом сайте по ходу прохождения материала.

Дата Тема Слайды Код Видео
1.10 NGS и экспериментальная процедура RNA-Seq Ссылка   Ссылка (Я.Диск)
8.10 Экспериментальная процедура scRNA-Seq Ссылка   Ссылка (Я.Диск)
15.10 Подсчёт экспрессий Ссылка   Ссылка (Я.Диск)
22.10 Контроль качества клеток Ссылка Ссылка Ссылка (Я.Диск)
29.10 Эмбеддинги (I) Ссылка   Ссылка (Я.Диск)
5.11 Эмбеддинги (II) Ссылка Ссылка Ссылка (Я.Диск)
12.11 Коррекция батч-эффекта Ссылка Ссылка Ссылка (Я.Диск)


Условия зачёта

Зачёт заключается в защите одного из восьми предложенных ниже проектов, а также устном опросе после него. Проекты не подразумевают одного «правильного» ответа, но подразумевают вдумчивую работу над поставленным вопросом, а также использование дополнительных открытых источников в ходе работы. За две недели до зачёта (дата будет оглашена на занятии) необходимо будет прислать мне на почту список соответствия студента и проекта. Каждый студент выполняет свой собственный проект.

Форма отчёта по проекту — это GitHub-репозиторий с презентацией и всем необходимым для проверки выполнения проекта кодом.

Список проектов будет опубликован позднее.