Биологический факультет МГУ / Магистратура «Геномика и здоровье человека» / Осень 2023
Курс состоит из 4 лекционных и 4 практических занятий. Все материалы будут выкладываться на этом сайте по ходу прохождения материала.
| Дата | Тема | Слайды | Код | Видео |
|---|---|---|---|---|
| 5.10 | Экспериментальная процедура RNA-Seq и scRNA-Seq | Ссылка | Ссылка | |
| 12.10 | Процессинг прочтений и начало анализа экспрессий | Ссылка | Ссылка | |
| 19.10 | Экосистема scverse и контроль качества клеток | Ссылка | Ссылка | |
| 26.10 | Статистические основы анализа экспрессий | Ссылка | Ссылка (частичная запись) | |
| 2.11 | Эмбеддинги клеток и работа с ними | Ссылка | Ссылка | |
| 9.11 | Анализ датасета PBMC из нескольких батчей | Ссылка | Ссылка | |
| 16.11 | Определение типов клеток и функциональный анализ | Ссылка | Ссылка | |
| 23.11 | Анализ траекторий и направления дифференцировки | Ссылка | Ссылка |
Зачёт заключается в защите одного из восьми предложенных ниже проектов, а также устном опросе после него. Проекты не подразумевают одного «правильного» ответа, но подразумевают вдумчивую работу над поставленным вопросом, а также использование дополнительных открытых источников в ходе работы. За две недели до зачёта (дата будет оглашена на занятии) необходимо будет прислать мне в Telegram или на почту список соответствия студента и проекта. Каждый студент выполняет свой собственный проект.
Форма отчёта по проекту — это GitHub-репозиторий с презентацией и всем необходимым для проверки выполнения проекта кодом.
Список проектов (будет дополняться комментариями позднее):